Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN2Q9H000 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN2Q9H000 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN2Q9H000 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms