Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NDEL1Q9GZM8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDEL1Q9GZM8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDEL1Q9GZM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms