Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4RQ9BZR6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN4RQ9BZR6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN4RQ9BZR6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms