Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP3Q9BZ76 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP3Q9BZ76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP3Q9BZ76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP3Q9BZ76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 849.5 ms