Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD2Q9BYW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD2Q9BYW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SETD2Q9BYW2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms