Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCO2Q9BYV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCO2Q9BYV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCO2Q9BYV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCO2Q9BYV7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms