Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPPD1Q9BV87 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPPD1Q9BV87 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNPPD1Q9BV87 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNPPD1Q9BV87 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPPD1Q9BV87 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNPPD1Q9BV87 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNPPD1Q9BV87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms