Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC32Q9BV29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC32Q9BV29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC32Q9BV29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC32Q9BV29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC32Q9BV29 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC32Q9BV29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms