Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDUFAF3Q9BU61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDUFAF3Q9BU61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.2 ms