Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX7Q9BT81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX7Q9BT81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX7Q9BT81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms