Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPKQ9BS16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPKQ9BS16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPKQ9BS16 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms