Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRG3Q99928 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRG3Q99928 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRG3Q99928 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRG3Q99928 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRG3Q99928 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms