Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN5Q99471 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFDN5Q99471 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN5Q99471 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms