Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NOTCH4Q99466 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOTCH4Q99466 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NOTCH4Q99466 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms