Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNKPQ96T60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PNKPQ96T60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PNKPQ96T60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNKPQ96T60 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNKPQ96T60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PNKPQ96T60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNKPQ96T60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNKPQ96T60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNKPQ96T60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PNKPQ96T60 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNKPQ96T60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PNKPQ96T60 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNKPQ96T60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNKPQ96T60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNKPQ96T60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNKPQ96T60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNKPQ96T60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNKPQ96T60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PNKPQ96T60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNKPQ96T60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PNKPQ96T60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms