Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX18Q96RF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX18Q96RF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms