Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC4A9Q96Q91 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SLC4A9Q96Q91 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A9Q96Q91 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC4A9Q96Q91 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC4A9Q96Q91 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms