Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOX2Q96NM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOX2Q96NM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOX2Q96NM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOX2Q96NM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOX2Q96NM4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms