Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL15Q96M94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL15Q96M94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL15Q96M94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms