Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C10orf90Q96M02 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C10orf90Q96M02 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C10orf90Q96M02 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf90Q96M02 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms