Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
EP400Q96L91 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
EP400Q96L91 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
EP400Q96L91 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EP400Q96L91 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
EP400Q96L91 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms