Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I2Q96KJ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COX4I2Q96KJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms