Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCHS1Q96JQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCHS1Q96JQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCHS1Q96JQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCHS1Q96JQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms