Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP3Q96JB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDK5RAP3Q96JB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP3Q96JB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK5RAP3Q96JB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms