Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML4Q96GE6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CALML4Q96GE6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALML4Q96GE6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALML4Q96GE6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms