Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF31Q96EP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF31Q96EP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF31Q96EP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms