Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTM5Q96DZ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMTM5Q96DZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMTM5Q96DZ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM5Q96DZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM5Q96DZ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1294.7 ms