Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RMDN1Q96DB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RMDN1Q96DB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RMDN1Q96DB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms