Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC58Q96CX6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC58Q96CX6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC58Q96CX6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC58Q96CX6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC58Q96CX6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC58Q96CX6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms