Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SNX21Q969T3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNX21Q969T3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNX21Q969T3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SNX21Q969T3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms