Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms