Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL1Q92935 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL1Q92935 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EXTL1Q92935 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms