Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIFAP3Q92845 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIFAP3Q92845 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIFAP3Q92845 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1262.9 ms