Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN4Q92575 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN4Q92575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN4Q92575 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN4Q92575 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms