Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERVK_113Q902F9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERVK_113Q902F9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERVK_113Q902F9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113Q902F9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms