Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PREX1Q8TCU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PREX1Q8TCU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PREX1Q8TCU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PREX1Q8TCU6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX1Q8TCU6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX1Q8TCU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PREX1Q8TCU6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms