Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBP-AS1Q8TBR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBP-AS1Q8TBR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBP-AS1Q8TBR5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms