Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM58Q8NG06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM58Q8NG06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM58Q8NG06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM58Q8NG06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM58Q8NG06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms