Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP18Q8NEJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP18Q8NEJ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP18Q8NEJ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP18Q8NEJ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms