Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TDRD9Q8NDG6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TDRD9Q8NDG6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TDRD9Q8NDG6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TDRD9Q8NDG6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TDRD9Q8NDG6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
TDRD9Q8NDG6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
TDRD9Q8NDG6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms