Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSANTD4Q8NCY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD4Q8NCY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSANTD4Q8NCY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSANTD4Q8NCY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSANTD4Q8NCY6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSANTD4Q8NCY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms