Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3Q8N9I9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3Q8N9I9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms