Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO5AQ8N6Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO5AQ8N6Q1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO5AQ8N6Q1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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