Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC33Q8N5R6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC33Q8N5R6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC33Q8N5R6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms