Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF2Q8N3S3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHTF2Q8N3S3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHTF2Q8N3S3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms