Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1KQ8N3J5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1KQ8N3J5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1KQ8N3J5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1KQ8N3J5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms