Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VSIG10Q8N0Z9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VSIG10Q8N0Z9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VSIG10Q8N0Z9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VSIG10Q8N0Z9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VSIG10Q8N0Z9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VSIG10Q8N0Z9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms