Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP3Q8IZU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP3Q8IZU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP3Q8IZU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP3Q8IZU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP3Q8IZU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms