Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC117Q8IWD4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC117Q8IWD4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC117Q8IWD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms