Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IFNL1Q8IU54 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL1Q8IU54 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IFNL1Q8IU54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFNL1Q8IU54 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL1Q8IU54 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFNL1Q8IU54 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms