Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NLRP13Q86W25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP13Q86W25 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP13Q86W25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NLRP13Q86W25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NLRP13Q86W25 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms